真空冷凍干燥機相對普通干燥方法，低溫凍干法具有如下優點：
1、許多熱敏性的物質不會發生變性或失活。
2、在低溫下干燥時，物質中的一些揮發性成分損失很小。
3、 在凍干過程中，微生物的生長和酶的作用無法進行，因此能保持原來的性狀。
4、 由于在凍結的狀態下進行干燥，因此體積幾乎不變，保持了原來的結構，不會發生濃縮現象。
5、 由于物料中水分在預凍以后以冰晶的形態存在，原來溶于水中的無機鹽類溶解物質被均勻地分配在物料之中。升華時，溶于水中的溶解物質就析出，避免了一般干燥方法中因物料內部水分向表面遷移所攜帶的無機 鹽在表面析出而造成表面硬化的現象。
6、 干燥后的物質疏松多孔，呈海綿狀，加水后溶解迅速而*，幾乎立即恢復原來的性狀。
7、 由于干燥在真空下進行，氧氣極少，因此一些易氧化的物質得到了保護。
8、 干燥能排除95%～99%以上的水分，使干燥后產品能長期保存而不致變質。
