凍干機的制冷壓縮機將蒸發器內的低壓(低溫)制冷劑吸入壓縮機汽缸內，制冷劑蒸汽經過壓縮，壓力、溫度同時升高；高壓高溫的制冷劑蒸汽被壓至冷凝器，在冷凝器內，溫度較高的制冷劑蒸汽與溫度比較低的冷卻水或空氣進行熱交換，制冷劑的熱量被水或空氣帶走而冷凝下來，制冷劑蒸汽變成了液體。這部分液體再被輸送至膨脹閥，經過膨脹閥節流成了低溫低壓的液體并進入蒸發器；在蒸發器內低溫、低壓的制冷劑液體吸收壓縮空氣的熱量而汽化(俗稱“蒸發”)，而壓縮空氣得到冷卻后凝結出大量的液體水；蒸發器中的制冷劑蒸汽又被壓縮機吸走，這樣制冷劑便在系統中經過壓縮、冷凝、節流、蒸發這樣四個過程，從而完成了一個循環。

　　凍干機在使用時不只需要留神本身的功用，還有溫度均勻性、加熱速率、真空度穩定性、抽氣速率等等。還要達到節能效果：

　　1、操控冰點真空單調法

　　操控冰點真空單調法運用凍干與真空單調的各自利益，在食物溫度上嚴峻操控其挨近冰點，但不能結冰，這樣不光節省了制冷能耗，更避免了食物的熱變性問題，也避免了相變進程中對生物細胞的損壞；

　　2、改動物料托盤的結構

　　物料托盤可從托盤材料的導熱性、料盤與物料的接觸傳熱面問題進行改進。選擇導熱性好的材料可有效地強化冷凍單調進程；

　　3、操控預凍速度和料盤裝載量

　　凍干機預凍速度影響冰晶的構成，較快的凍住速率冰晶較小，不利于行進，脫水時間長，但干后溶解快。較慢的凍住速率冰晶較大，對單調脫水有利，但干后溶解慢。其他，單位面積料盤上，物料堆積的厚度愈薄，傳熱和傳質速度越快，單調時間愈短。

　　藥品干燥的方法多樣，如曬干、煮干、烘干、噴霧干燥和真空干燥等，普通干燥方法通常都在0℃以上或更高的溫度下進行。干燥所得的產品一般都存在體積縮小、質地變硬的問題，易揮發的成分大部分會損失掉，一些熱敏性的藥材有可能變性、失活。因此，干燥后的產品與干燥前相比，在性狀上有很大的差別。

　　　凍干機是一種集制冷系統、真空系統、導熱油加熱系統和除濕系統于一體的新型設備。它可以利用盒子里的材料空間來干燥。適用于高檔原料藥、中藥材、生物、野菜、脫水蔬菜、食品、水果、化工、醫藥中間體等物料的干燥。近十年來，冷凍干燥工業取得了長足的發展，其應用領域逐步擴大。在生命科學研究領域，真空冷凍干燥技術可用于抗體、蛋白質、組織和微生物的研究，因此在生物制藥領域得到了廣泛的應用。在制藥工業中，真空冷凍干燥被廣泛應用于制備疫苗和抗生素。凍干機凍干法基本上在0℃以下進行，即在產品凍結的狀態下進行，只在后期降低產品的殘余水份含量時，才讓產品升至0℃以上的溫度，但一般不超過40℃。在真空條件下，當水蒸汽直接升華出來后，藥物剩留在凍結時的冰架中，形成類似海綿狀疏松多孔架構，因此它干燥后體積大小幾乎不變。再次使用前，只要加入注射用水，又會立即溶解。