在一般情況下，藥品需經凍干是由于其溶液狀態下的不不亂性。很多抗生素如某些半合成的青霉素、頭孢菌素和紅霉素、強力霉素、氯霉素的鹽類都是由凍干工藝制造的。可以預計在出產過程中這類產品的污染水平很低，由于它們是抗生素。而其他類凍干劑如甲基潑尼松龍琥珀酸鈉鹽及很多生物制品在溶液狀態下卻毫無抗菌作用。為盡量降低這類藥品的微生物污染程度，通常需要在藥液灌注在內步驟容器內之前，將溶液中含有的雜質和細菌用過濾的方法去除。

　　配制好的藥液需要使用適當孔徑的過濾器進行過濾，以去除藥液總的雜質和細菌。通常的藥液過濾采用兩級以上不同孔徑的過濾器串聯過濾。在實際出產過程中，通常采用不同孔徑的濾器對藥液分級過濾，有時還需要脫炭處理，去除熱原物質，后通過一個孔徑為0.22μm的微孔過濾器對藥液過濾除菌。藥液過濾時，要特別留意確認除菌過濾器的孔徑及其在出產過程中完整性，即除菌過濾器濾膜要進行氣泡點試驗，試驗合格后使用。調配操縱前，操縱職員先對原輔料、名稱、批號等進行核對，檢查外觀質量，再按處方稱取原料，然后進行調配操縱，溶液在供充填前進行無菌過濾，過濾完后對過濾器進行完整性試驗。當藥液配制系統使用的方法是一邊過濾，一邊灌裝時，這種系統則應該使用兩個除菌過濾器串聯使用，以保證即便是過濾灌裝過程中泛起一個過濾器濾膜損壞，也不會影響濾液的無菌性。

　　為從工藝中有效地去除活的微生物并獲得無菌藥液，使用過濾器的名義孔徑通常為0.22mm或更小。某些情況下，要考慮使用雙重除菌過濾器，尤其是藥液灌裝過程中或灌裝完成前，沒有前提對過濾器進行完整性試驗的情況下。

　　藥品出產中所用的除菌濾膜孔徑一般不超過0.22μm。過濾器不得對被濾過成分有吸附作用，也不能開釋物質，不得有纖維脫落，禁用含石棉的過濾器。濾器和濾膜在使用前應進行潔凈處理，并用高壓蒸汽進行滅菌或作在線滅菌。更換品種和批次應先清洗濾器，再更換濾膜。