凍干機的型號中的數字代表凍干面積，用戶應根據自己的需要，通過計算來確定需用多大凍干面積的凍干機。凍干機的板層溫度均勻性和平整度,對產品質量的均一性有很大的影響,溫度均勻性和平整度越好，則凍干產品質量的均一性也越好。凍干機擱板溫度控制有加熱器型和中間流體型，采用中間流體控制板層的凍干機擱板溫度均勻性和平整度好，這種凍干機板層為空心夾層結構，板層的制冷和加熱均通過中間流體在板層內部的流體通道循環來實現，因此板層溫度均勻一致。總體而言，醫藥用凍干機板層溫差應控制在±1.5℃，板內溫差為±l℃，食品凍干機可適當放寬。 若凍干機擱板溫度不均，可能的原因如下：
1.擱板溫度的測定與控制以熱媒進（出）口處為主參數，實際擱板表面溫度均勻性、擱板與擱板間的溫度差未真正達到標準要求，溫度的均勻性需要進行滿足相應工藝要求的驗證。經常有用戶反映的凍干小瓶內殘余含水量不一致，有的相差很大，沒有達到產品設計殘余含水量標準，這里當然還有其它方面因素。
2.擱板結構設計不符合熱傳導特性。在制造上，擱板表面的平整度如從整體平板表面上進行直尺測量似乎在設計要求內，實際上在局部會存在著不理想之處，如擱板表面焊點位置打磨后有“凹痕”和另一面內部折流條間斷焊所產生的熱脹冷縮后外平面形成“凹痕”，這種加工工藝直接影響擱板至制品/托盤的熱傳導性能。現在國內廠家的擱板結構設計表面無焊點、且由新工藝處理，表面經特殊工藝處理后非常平整，無需進行機械切削所帶來的熱應力所致變形，這是值得借鑒之處。
3.加熱（冷）媒傳熱特性或流程設計有欠缺。熱媒至每塊擱板的流量均勻性是否基本一致也是一門值得研究的課題。熱媒分配設計可以參照板式熱交換器流量分配方式，或把多根軟管較集中在一起。
