凍干機自動上料和卸料系統一般適合在新建生產線中使用。從概念上來說，設計者先考慮工藝要求的需要，然后選擇合適的系統。另一個適合用自動上料和卸料系統的情況是在已建廠房的擴展部分生產一種新藥，在這種情況下，此企業已經投入了生產，新生產線只是其產品的一部分，這樣他們就可以充分的利用其它的已有資源來吸收這種新的技術。許多制藥廠商一直在考慮添置一套自動上料和卸料系統，這樣他們在制造工藝上就會有一種優勢，而且客戶也會感覺到這是一種科技，更有利于他們的產品銷量，但是，如果想簡單的用帶自動上料和卸料的凍干機來取代現在的正在運行的設備是不可取的，這樣做會帶來很大的風險，而且還須因此進行相關的程序和技術的認證。其中較重要的問題就是凍干機和灌裝機的吻合和隔離，具體會牽涉到其它很多因素，如產品的產量、地板的平面度、板層的平面度和上料時板層定位等。

　　隨著冰不斷升華汽體的移走，也帶走物料的熱量，使物料溫度（冰溫）持續走低，從而引汽冰的飽和蒸汽壓降低，升華速度放慢。為保持一定的升華速率，就必須不斷給物料補充熱量。熱量補充太少會降低升華速率，熱量補充太快會引起冰的溶化，導致物料塌陷凍干失敗。

　　凍干與通常的曬干、煮干、噴霧干燥及真空干燥相比有如下突出的優點。

　　a.凍干是在低溫下干燥的，不會使蛋白質產生變性，但可使微生物等失去生物活力。這對于那些熱穩定性能差的生物活性制品、生物化學類制品、基因工程類制品和血液制品等的干燥保存特別適用。

　　c.在低溫干燥過程中，微生物的生長和酶的作用幾乎無法進行，從而能好地保持物質原來的性狀。

　　d.干燥后體積、形狀基本不變，物質呈海綿狀，無干縮，復水時與水的接觸面大，能迅速還成原來的形狀。

　　e.因一般是在真空下干燥，故氧氣極少，使易氧化的物質得到了保護。

　　f.能除去物質中95％～99.5％的水分，制品的保存期長。

　　凍干機的設計制造工藝、零部件的選擇與凍干機的質量、可靠性、使用壽命有著直接的關系。

　　為了使板層的致冷和加熱溫度均勻一致，目前凍干機制造廠家大部分采用空心夾層板層，內部帶有隔條，由傳溫中間流體循環在板層之中。老式或落后的制造方法是在板層的上下二塊或其中一塊板上打許多孔，用塞焊法把金屬板與隔條焊接起來，然后機械加工而成。由于凍干工藝的低溫、真空甚至高溫、受壓的特殊工況，這種焊接方法在使用一定年限后，可能會在塞焊處滲漏傳溫流體，在真空狀態下，傳溫流體瞬間霧化，導致凍干品被污染而報廢。而新式或先進的制造方法是上下二塊金屬板均不打孔，使用特殊的內焊設備制造而成，從根本上消除了滲漏的發生。