低溫冷凍干燥機主要由以下幾大部分組成：凍干機箱體、導熱隔板與升降壓塞系統令凝器、真空系統、液氮制冷系統、循環系統、控制系統。 低溫冷凍干燥機的箱體是一個密閉的空間，主要用于存放待凍干的物品。凍干機箱體由316L不銹鋼板制成，箱體內表面粗糙度為Ra＜0.5-0.8，平整度＜±1mm/m，均為圓弧結構，便于清潔。
低溫冷凍干燥機的液氮制冷系統：
液氮制冷凍干機組是采用-196℃的液氮蒸發，達提到制冷目的。其主要的特點是：
1.氮氣來源廣、無制冷歷壓縮機，耗電省、維修簡單，不需要冷卻水、冷卻速度快，戶冷卻能力高；
2.噪聲低、運行可靠。
據文獻記載，1kg的水結冰然后使其升華約需19.5kg液氮。液氮制冷系統主要通過一個特殊設計的液氮低溫換熱器為箱體內的隔板和冷凝器提供冷源。其特點是溫度低，凍干箱內隔板的溫度圍可在（-80~80）℃之間，而冷凝器內的盤管的溫度可達到-110℃。整個凍干過程，制冷系統運車穩定，且能保證凍干室和冷凝器內溫度長期保持在低溫狀態。
低溫冷凍干燥機的循環系統主要控制凍干過程中制品的溫度的升降。這定些載熱體通過凍干機的冷凍系統或電加熱系統進行升溫或降溫，并在凍干箱隔板內循環，與凍干制品進行均勻的熱量傳遞，從而達到傳熱的目的。換熱系統必規須具有一定的換熱效率，隔板溫度抄制精度要求一般要達到±1℃以下。
